?

Log in

No account? Create an account
Учебник/руководство по регрессионному анализу в SPSS для медиков-биологов? - Добрая фея с топором

> Recent Entries
> Archive
> Friends
> Profile
> My Website

May 23rd, 2012


Previous Entry Share Next Entry
06:34 am - Учебник/руководство по регрессионному анализу в SPSS для медиков-биологов?
Что-то специальное коммьюнити не торопится пропускать мой пост с премодерации. Продублирую у себя, а вдруг?
Посоветуйте, есть ли у вас на примете русский или английский толковый и понятный учебник по статистике, желательно с уклоном для медиков-биологов, а идеально - с понятным руководством к действию именно в SPSS? Мне нужно научиться,
- как в SPSS работать с ROC curves, а именно надо научиться как правильно определить cut-off value для биологического теста учитывая чувствительность и специфичность,
- и как именно работать с регрессией. То есть как получать данные типа "факторы А и В независимо увеличивают риск события С" или "при наличии такого-то антитела А и если тест В положительный, то риск заболевания возрастает в 2 раза", то есть multiple regression, если я понимаю правильно
Базовые знания по статистике есть, но их явно не хватает. Для этой темы читала учебник по статистике для ВУЗов (было все понятно, но это было давно и от этого сейчас не легче), онлайн читала теорию (уровня как в википедии), вроде бы в основном понятно, тыкалась в самоучитель по SPSS, но даже воспроизвести те примеры, что там показывают, у меня не получается.
SPSS есть 13.0 и 17.0.
Спасибо.

(46 comments | Leave a comment)

Comments:


[User Picture]
From:sorhed
Date:May 23rd, 2012 10:39 am (UTC)
(Link)
А тебе как срочно? У меня жена просто отлично владеет SPSS, так что как придёт, спрошу у неё.

Про пункт 2 — это, я так понимаю, bayesian networks.
[User Picture]
From:tanchik
Date:May 23rd, 2012 11:10 am (UTC)
(Link)
Мне нужно было пару лет назад, так что не особо к спеху, ну недели 2, например. :)
Поясню подробней - есть данные, около 80 колонок с разными клиническими и лабораторными параметрами, числовыми и категориальными, а еще типа "да-нет". И где-то 70 наблюдений. Есть сильные значимые корреляции между фактором, который меня интересует, назовем его "Треги" и некоторыми этими параметрами, около десятка, положительные и отрицательные. А часть факторов "да-нет", если их разделить на эти 2 группы, то они достоверно различаются опять же по "Трегам", таких штук пять. То есть я описала статистику, что мол коррелируют, или что мол различаются, а значит возможно что влияют на "Треги". С этим проблем нет. Но от меня хотят большего, а именно - а можно ли предсказать (с такой-то вероятностью) что вот если фактор А увеличен, то "Треги" уменьшатся? Если да, то какой Cut off value для фактора А и как его определила с ROC? А зависимы ли между собой факторы А и В, оба из которых сильно коррелируют с "Трегами", или они влияют на "Треги" независимо друг от друга? А если корреляция между "А" и "Трегами" становится сильней, когда из группы выкидываем всех девочек, это значит что фактор "пол" тоже имеет значение, и как это показать? А какая у вас модель для этих факторов, какие из них важней для "Трегов", а какие не очень?
В общем, на таком уровне мне уже не хватает моего умения просто оценивать нормальность распределения, сравнивать средние и считать корреляции. И на этом вот затык.
[User Picture]
From:itworks
Date:May 23rd, 2012 10:56 am (UTC)
(Link)
Вот я бы смотрел в сторону applied книг, вроде вот таких:

http://www.amazon.com/Applied-Statistics-Using-STATISTICA-MATLAB/dp/3540719717/ref=sr_1_1?ie=UTF8&qid=1337769887&sr=8-1

там тебе и SPSS, data regression и ROC curves, стоит правда эта книжка огого и непонятно насколько она хороша. Хотел тебе каких-нибудь redbooks по SPSS посоветовать (всеж я в этой конторе работаю) но они все ужасное говно
[User Picture]
From:tanchik
Date:May 23rd, 2012 11:19 am (UTC)
(Link)
Спасибо! Я вечером спрошу Акимку.
[User Picture]
From:jamaica1953
Date:May 23rd, 2012 11:08 am (UTC)
(Link)
http://www.tnu.in.ua/study/downloads.php?do=file&id=3637
Вот, я обычно этим пользуюсь ПФ Рокицкий "Статистика для биологов" Книгу просто скачать
Главная ошибка, с которой сталкивалась на практике. При всех манипуляциях по подсчету среднего, стандартной ошибки, сигмы и тп, есть ограничение, на которое обычно никто не обращает внимания. Распределение исследуемой величины дляжно быть нормальным. То бишь представлять собой симметричную кривую с максимумом. Если это не доказано априоре, сначала надо самолично убедиться.
Пример. Средний возраст населения. Распределение населения какой-либо страны по возрасту обычно не является нормальным (см. половозрастное распределение). Но слова "средний возраст" постоянно встречаются в статотчетах.
Или. Распределение по показателю гемоглобина. Да, мы знаем, что у мужчин и женщин средний показатель гемоглобина разный и уже умеем разделять всех людей на эти группы. Но. Оказывается, что в каждой возрастной группе (скажем, с шагом 10 лет) распределение по показателю гемоглобина людей одного пола тоже несимметричное! А вот этого пока нигде нет - мое собственное открытие...
[User Picture]
From:tanchik
Date:May 23rd, 2012 11:15 am (UTC)
(Link)
Спасибо! Я скачаю. Перед тем как что-то считать, я все факторы прогоняю на тест по нормальности и еще глазами смотрю. То есть потом юзаю только непараметрическую статистику, если распределение не нормальное. Три группы Т-тестом тожене сравниваю. :)
Так что на этом уровне мне кажется я не лажаю. У меня затык на более сложном уровне, вот тут пояснила
http://tanchik.livejournal.com/464893.html?thread=22271229#t22271229
[User Picture]
From:prosto_defka
Date:May 23rd, 2012 11:37 am (UTC)
(Link)
Мне вот этот учебник нравится: http://elibrary.karelia.ru/book.shtml?id=3970
Товарищ читал нам курс статистики, много и толково рассказывал.
[User Picture]
From:torash
Date:May 23rd, 2012 11:42 am (UTC)
(Link)
a help и tutorial в самом SPSS не смотрели?
Мне кажется, они с 13 версии очень хорошии стали. У меня другие задачи и регрессии редки, но я, помнится, много ценного в хелпе и особенно тьюториале вытащила.

Могут быть полезны книги для экономистов - они иногда написаны как для идиотов и очень в этом смысле полезны.
[User Picture]
From:tanchik
Date:May 23rd, 2012 11:47 am (UTC)
(Link)
Смотрела. Воспроизвести не получается - SPSS не нравятся те variables что я ей пытаюсь скормить по образцу из руководства. Никакие не нравятся, что-то я делаю совсем не правильно.
[User Picture]
From:dok_zlo
Date:May 23rd, 2012 11:48 am (UTC)
(Link)
[User Picture]
From:dok_zlo
Date:May 23rd, 2012 11:50 am (UTC)
(Link)
это если вообще. а конкретно спроси у мужской половины уборщщщщиц. Андрей Николаевич должен или сам знать или знать где смотреть.
[User Picture]
From:fea_dreams
Date:May 23rd, 2012 01:48 pm (UTC)
(Link)
У меня есть учебник Наследова по обработке стат.данных в SPSS, он ориентирован больше на социологов и психологов, но все методы рассказаны внятно с пошаговыми инструкциями как это сделать.
[User Picture]
From:tanchik
Date:May 25th, 2012 10:16 am (UTC)
(Link)
А как он называется?
[User Picture]
From:elentin
Date:May 23rd, 2012 02:33 pm (UTC)
(Link)
Хорошая книжка по статистике - http://antonpiter.narod.ru/7361/5semestr/VM_analiz_dannix.PDF
[User Picture]
From:tanchik
Date:May 25th, 2012 10:18 am (UTC)
(Link)
Спасибо! Скачался файл. Сегодня начну изучать. :)
[User Picture]
From:elentin
Date:May 23rd, 2012 02:34 pm (UTC)
(Link)
Ну да, как обычно, жж посчитал комментарий со ссылкой на сторонний ресурс (см. выше) за спам :-//
[User Picture]
From:whatevergospodi
Date:May 23rd, 2012 04:16 pm (UTC)
(Link)
и мой тоже. там были ссылки на учебник Statistica и Хан академи :(
[User Picture]
From:whatevergospodi
Date:May 23rd, 2012 04:15 pm (UTC)
(Link)
я очень не люблю Спсс, прямо органически не переношу.
в прошлом году мне показали JMP - его можно скачать бесплатно на месяц демо-версию (наверное, если компов больше чем один, можно скачивать несколько раз. Это танк (и стоит он, как танк) - намного удобнее и быстрее, чем все остальное.
Сама я пользуюсь в основном Statistica - и очень рекомендую - их учебник. Он очень неплохой, понятный, в нем легко найти то, что надо (ну, мне так показалось, по крайней мере)
http://www.statsoft.com/textbook/ - попробуй посмотреть его - там вполне биологические примеры в основном приведены.
еще сейчас khan academy (khanacademy.com) - сделали тоже обучающие видео по статистике - мне очень понравились, у них очень правильный подход (они сами смотрят статистику того, как их просматривают люди и на основе этого меняют свои видео) - посмотри, вдруг там будет то, что тебе нужно.
+ когда я готовлюсь к интервью, то смотрю видео на ютюбе - прямо набираешь в поиске - ютюб, спсс и тему (на английском, само собой).
[User Picture]
From:tanchik
Date:May 25th, 2012 10:22 am (UTC)
(Link)
Спасибо, что напомнили про Статистику. У меня она раньше была, а к ней - книжка страниц на 600 как ей пользоваться. :) Потом книжку я продала, уезжая из России, программа куда-то проэтосамилась.. и когда понадобилась статистика снова, оказалось что и СПСС хватает на все. Вернусь поглядеть на статистику все-таки, может с ней будет удачней. Попробую учебник и этот сайт тоже.
[User Picture]
From:drolya
Date:May 23rd, 2012 04:28 pm (UTC)
(Link)
Вот там выше советовали книги для экономистов. Как экономист порекомендую вот что: Damodar N. Gujarati "Basic Econometrics" и его же "Essentials of Econometrics". Они прекрасные.
[User Picture]
From:torash
Date:May 23rd, 2012 06:32 pm (UTC)
(Link)
Точно! И спасибо, что про них напомнили. Давно не в англоязычной среде - забыла про них. Но они прекрасные.
[User Picture]
From:pascendi
Date:May 23rd, 2012 04:35 pm (UTC)
(Link)
Посоветуйтесь с uborshizzza, один из них (их там двое на аккаунте) преподает в меде как раз медстатистику.
У них в блоге, кстати, выложены фрагменты учебника на эту тему -- толковые.
[User Picture]
From:ristana
Date:May 23rd, 2012 06:40 pm (UTC)
(Link)
+1 училась у него .прекрасный специалист.
[User Picture]
From:maksina
Date:May 23rd, 2012 07:11 pm (UTC)
(Link)
Еще актуально? Если да , то озадачу мужа - он SPSS уже много лет преподает, правда не медикам, а социолгам
[User Picture]
From:tanchik
Date:May 24th, 2012 12:28 pm (UTC)
(Link)
А можно показать мужу вот этот текст
http://tanchik.livejournal.com/464893.html?thread=22271229#t22271229
и спросить, куда конкретно мне копать, чтоб на эти вопросы найти решения? Я получила много советов про учебники. Только вот не знаю пока, помогут ли они.
From:(Anonymous)
Date:May 31st, 2012 01:43 pm (UTC)
(Link)
Здравствуйте!

я не по теме поста:). но хотела бы Вас как иммунолога, работающего в штатах спросить, как Вы относитесь к "любви" отечественных врачей назначать процедуру иммунизации лимфоцитами мужа или капельницы с иммуноглобулинами при обнаружении так называемого иммунологического бесплодия или бесплодия неясного генеза.
Просто данной темой занимаются весьма солидные организации центр акушерства им. Кулакова или ЦИР в Москве или даже очень уважаемая профессор Сидельникова, но питерские врачи эту проблему отвергают. Можете ли Вы раскрыть Ваше мнение? Вот здесь мнения против http://forums.rusmedserv.com/showthread.php?t=173962, а есть ли мнения за?
Заранее огромное спасибо.
[User Picture]
From:tanchik
Date:May 31st, 2012 02:12 pm (UTC)
(Link)
Я прочитала топик по ссылке и могу подписаться под каждым выводом Бориса Каменецкого, его обзор очень толковый. К сожалению, отсутствие эффекта и даже неизученный механизм никаким образом не помешают уважаемым врачам из некоторых центров продвигать методику..

> Go to Top
LiveJournal.com