Category: медицина

страус

лытдыбр, злобный под катом

1. - На работе коллега во время выделения клеток время от времени поднимает лицо вверх и с пробиркой в руках говорит что-то типа "Мняммм мняммм мняммм!". Ну то есть я понимаю это конечно критический шаг эксперимента, но в остальном я не подозревала подобной набожности от нее, чтоб аж молиться за здравие клеток. :) И только вчера я обнаружила, что прямо над ее головой на ламинаре вообще-то прилеплен таймер.

2. Ходили с Акимом и Максом гулять в сад. Там мы с Максом зашли в женский сортир, из которого мне пришлось довольно быстро улепетывать. :) Потому что Макс, пока я мыла руки, заглянул под дверцу в кабинку к другой тете и радостно сказал ей: "Ку-ку!"

3. Покупаем новый холодильник на работе.Collapse )
страус

Мракобесы везде

Сволочную гомеопатию в США тоже, кстати, продают на каждом углу. Еще и в описании все завуалировано, так что приходится продираться чтоб выяснить что ж это за средство такое
http://www.target.com/p/hyland-s-ear-ache-drops-0-33-oz/-/A-14087350
https://www.amazon.com/Similasan-Relief-Drops-Ounce-Bottle/dp/B00014THNG

Правда, разобраться чуть легче, так как тщательно спрятанные ключевые слова про "всенатуральное" и "гомеопатия" все равно найдутся.
Когда ж ее запретят уже наконец.

И пользуясь случаем - ушные капли которые не сраная гомеопатия, младенцу, при отите, в США, есть идеи?
ЗЫ: ага, похоже что все могло бы работать, то есть капли не на гомеопатии, только по рецепту. Прекрасно
страус

Обидеть ученого может каждый

Сидеть в пять утра с кружкой кофе за компом и гуглить по ключевым словам "Как узнать, нормально ты выспался или нет?" - в этом что-то есть. :)) Ну буду считать что выспалась, раз есть такие вопросы.
Напишу небольшое продолжение истории про то как у меня на работе отжали проект. Наверное, самое точное выражение тут будет "ограбили на проект". Насколько я вижу, не всем было понятно что же реально у меня случилось и почему отнять проект в науке это совсем не круто. Особенно это было не понятно офисным работникам. Что такое проект в офисе против проекта в науке?

Про гипотезы. Проект в науке это целый комплекс уже сделанных данных, подкрепляющих его гипотез, планов что делать дальше и как поступить, если данные будут такими (вариант А) или такими (вариант Б). Сам путь от гипотез(ы) до получения первых крутых данных обычно долгий и болезненный, а чаще всего и довольно дорогой, по крайней мере у нас. Гипотез этих может быть сколько угодно, особенно если ты много читаешь по своей теме, только вот 99,9% из них ничего не стоят, так как выведены из интересных наблюдений, которые на твою тему на самом деле не распространяются (и выяснишь ты это только потом), или выведены из чужих ошибок.

Про ошибки. А ошибки это подавляющее большинство данных в свежих статьях, Collapse ) И мы обнялись, расцеловались в десны и разошлись по своим делам. Плохо только что я не умею в таких случаях искренне, широко и сердечно улыбаться. Надо потренироваться перед зеркалом, вот что.

Продолжение ессно будет. Но когда я буду о нем писать - вот это неизвестно.
але?

Диагностика аллергии на еду – санпросвет. Часть 2.

Итак, в первой части мы разобрали две гинекологические ерунды про иммунологию. Первая – что мол лишь аллергические реакции могут быть опасны для жизни. Вторая ерунда что мол аллергические реакции не зависят от дозы, а вот реакции непереносимости мол всегда зависят. Продолжим работу над ошибками.
Третья ерунда звучит вот так «Совершенно не важно, вводите ли вы часть дозы, и даже Collapse )
але?

Диагностика аллергии на еду – санпросвет. Часть 1

Как вы думаете, какое качество текста про особенности ведения патологических родов у беременных с сахарным диабетом я, иммунолог-ученый, могу написать? Ну если тщательно почитаю литературу, то наверное на уровне обычного реферата среднего студента-медика. А если я не стану ничего читать, но вспомню двухнедельные курсы по акушерству и гинекологии, которые вела некий гениальный акушер, для нас, терапевтов-легочников?
Ну.. эээ..
В общем, как uncle-doc однажды уже отметил, некоторые просветители даже лучше бы может и не пытались просвещать, так как от их просвещения вреда может быть намного больше, чем пользы. Это я про аллергическое эссе, написанное врачом- специалистом по экстрагенитальной патологии беременных, на основании пройденных ею много лет назад двухнелельных курсов по аллергологии (шта?)
http://dok-zlo.livejournal.com/1999499.html

Аллергописатель-гинеколог ввела понятия Истинной и Ложной аллергии, мол, настоящая аллергия совсем не зависит от дозы аллергена, и только она бывает опасной. Collapse )
Лапы!

Отпуск!

Впереди длинный, аж до 5 вечера, день отпуска. И дохрена дел. Чем бы его занять?
- довыкапывать кусты из травы, положить вокруг них агроволокно и обновить ленты, чтоб в мое отсутствие кусты не уничтожили наши подстригатели газона и перерезатели наших садовых шлангов. А да. Шланги смотать, иначе опять перережут оба
- положить вокруг огурцов агроволокно и сделать ленты на столбиках вокруг них для той же цели, иначе вернусь а огурцов не будет
- слазить на сайт авиакомпании, найти правила, найти нужные чемоданы и найти, измерить, и собрать хотя бы половину вещей Макса в отпуск. Постирать если не хватает чистого
- выяснить какого я нынче размера в разных местах по отношению к прошлому лету и что самой брать в отпуск. И есть ли у меня купальник?
- дописать пост про диагностику пищевой аллергии
- попробовать все же сделать хотя бы часть ревизии своей статьи
- вытянуть ноги за компом и долго, с наслаждением тупить в комп ничего полезного не делая
- сходить на сайт журналов, найти от них пароли и указать чтоб в течение пары недель мне не слали бы на ревью статей. Или забить, понадеявшись на лучшее
- разобрать хотя бы 5-10 штук из горы неотвеченных емейлов, взяв выборочно.. с конца? рандомно из 50 последних? с начала июня?
- привязать сетку для вьюнка спереди крыльца и кинуть некоторым вьюнкам веревочку, так как через неделю они будут уже на полметра длинней и некоторые сильно отрастут не туда
- прошерстить холодильник и кухню на предмет продуктов, которые не доживут до нашего возвращения и проследить, чтоб они были съедены или выкинуты
- по всему дому выкинуть ведра, если в них мусор из портящихся продуктов, иначе по возвращению будет запах и заведутся опять муравьи или дрозофилы. Да.
Ну что, пора начать отдыхать! А то не успею за день. ;)
але?

ссылочная

У меня новость - я созрела для заведения аккаунта на фейсбуке (созрела морально, но не завела пока, и это может быть не оч скоро). Но я это к чему - если вы хотите не потеряться, то складируйте плиз вот сюда кто вы там, и я когда заведу, буду в этот пост смотреть как кого найти).
Теперь ссылки, разгружаю вкладки
1. Необычный звонок врачу. Я б назвала иначе, но будет спойлер
http://onoff49.livejournal.com/518294.html
И вот, соответственно, книга "Не уверен - не умирай!"
http://aldebaran.ru/author/rudich_pavel/kniga_ne_uveren_ne_umirayi_zapiski_neyirohirurga/
А вот от другого френда, писателя и врача
https://ridero.ru/books/proshhaj_petenka/

2. в копилку избранного к моей истории "Как реанимировать побывшую на суше рыбу" вот руководство что делать если птица врезалась в окно и упала вам под ноги
http://bjorn-varulv.livejournal.com/112721.html

3. И кстати, поиск яндекса по моему ЖЖ больше не работает от слова совсем вообще ни на что. Что я делаю не так и как искать теперь записи в ЖЖ по ключевым словам? Помогите люди добрые?

4. Потрясающе трогательная история про похороны презервативов
http://upsya.livejournal.com/5697377.html
и история про Очень Вежливого Таксиста
http://upsya.livejournal.com/5698735.html

5. Если кто-то все еще не в курсе, то вот огромная подборка фото питерской рок-тусовки времени 1984-89, выложила Джоанна Стингрей
http://www.joannastingray.com/leningradred-wave-period-1984---1989.html

6. Санпросвет про бутылочки для детей, если вы вдруг не в курсе. Развинтите вашу и.. будете в курсе
http://kacho.livejournal.com/1658930.html

7. Прекрасная подборка шевелящих волосы на жопе историй про недвижимость. Мотивирует на услуги риэлтера
http://katenka.livejournal.com/488451.html

8. И вот этот выпуск +100500 не оставил меня равнодушной настолько, что хочу поделиться. Я почувствовала себя ужасно, невообразимо древней, увидев в этом выпуске видео о том, как двое девушек не смогли позвонить используя обычный дисковый телефон. Обычный! Дисковый! Это ведь оказывается не так уж и интуитивно понятно. А у кого-то такие остались, интересно?
http://carambatv.ru/humor/100500/antiqe-phone/

Эээ... у меня все хорошо но Макс уже проснулся и емае, я опять исчезаю. :(
Жж читаю! Писать не могу пока особо
лаба

Гомеопаты пишут псевдонаучную хрень высокого качества

Сабж. И бубликуют ее в PlosOne. На днях у меня внезапно выдалось утро для печатания всеми 10 пальцами (что бывает крайне редко), так что я тряхнула стариной и разобрала эту хрень. Чтение не захватывающее, к сожалению. Но надеюсь общая мысль моих заметок понятна даже не специалистам.
Вот тут у дяди Дока пост с рассказом как что
http://uncle-doc.livejournal.com/375513.html
страус

Вопрос по статистике - то ли кейс-контроль, то ли пре-пост данные?

У меня вот такой сабж - каким бы тестом вы считали такие данные (см рисунок)?

Объясняю: на этапе планирования мы предполагали, что у нас 30-40% шанс получить нужный тип клеток из крови пациента после того как он получил пересаженный орган. И у нас 80-90% шанс получить этот тип клеток у пациента до пересадки органа. Мы также знали набор из 5-6 факторов, которые точно влияют на состояние наших клеток (и эти факторы отвечают за variability наших клеток у разных пациентов). И наша задача была получить 2 группы образцов: до пересадки и после пересадки. Наш главный вопрос - меняются ли наши клетки после пересадки органа.
В итоге на этапе до пересадки, когда шансов получить клетки больше, мы сделали "гнезда" - группы пациентов по 3-4 человека, у которых значимые факторы сопоставимы. Получилось даже сопоставить по 9 факторам. То есть "matched" контроли такие, получается. А затем мы пытались выделить клетки у всех, кто получил пересадку органов. И если хотя бы один из "гнезда" давал нам эти клетки, мы получали этот один "case" из группы "после". Около половины "гнезд" пропали впустую - не удалось получить ни одного образца после пересадки. Ни в одном из "гнезд" два образца после пересадки выделить не получилось. Не все пациенты дождались свои органы, не все шло гладко и на этапе до пересадки, часть данных банально потеряли или не собрали и пришлось выключить соответствующие образцы, поэтому на этапе до пересадки в "гнезде" у нас по 3 или 2 образца. Вот такие данные.
И вопрос повторю - чем бы вы считали такие данные? Главный наш вопрос - различаются ли клетки "до" от клеток "после"? Признак количественный, распределение не нормальное, но может быть нормализовано. Если их просто в кучу сложить и сделать тупо Т-тест, не учитывая "гнезда" и не учитывая что это повторные измерения, то будет p value на грани, то есть 0.045. Но хотелось бы сделать правильнее и красивее, и из-за микроскопической величины группы после пересадки (всего 9 образов), и из-за "гнездности", и из-за того что технически это все-таки повторные обследования для одного человека из каждого "гнезда". Если просто взять те самые 9 человек из группы до и после, конечно никакой статистической разницы не будет - слишком мелкая группа со слишком большой дисперсией внутри группы.
Только пожалуйста, не нужно давать советы о том, как надо было проводить эту работу. Она уже сделана, и я не могу в этом изменить ничего, да и не могла особо повлиять и на этапе планирования. Ну то есть я выслушаю совет на будущее для других работ, но на сейчас это будет бесполезно. Нужен совет что сделать с данными. Разумное, чтоб доброе и вечное, а не выкинуть. :)
Спасибо!
Зы: пост про Максика воспоследует. У нас все живы и здоровы, а мне со след недели уже на работу, вот, доделать пытаюсь.
Лапы!

Пост про статистику и язык

1. Про язык, сегодня
- Аким, сорри, тут небольшой messed up с твоим плейсметом, я после еды их все соберу и в лаундри кину
- Таня, ты можешь все это сказать по русски?
- Хм.. Сейчас попробую. Аким, извини, тут небольшой срач на твоем.. на твоем подтарелочном коврике? на твоем настольном матрасике? на твоей тарелочной тряпочке. Я потом их все соберу и постираю, вот. :)
Если бы мой английский улучшался с той скоростью, с которой я делаю англосуржик из своего русского..
--------------------
2. А по поводу редактирования статьи - спасибо за участие. Конец истории: я была добра, написала авторам minor revision с требованием перепослать новую версию на очередной раунд ревью. В тексте я просто указала, что авторы исправили большинство проблем, но к сожалению проблема со статистикой осталась. И что я рекомендую им почитать про multiple comparison (http://en.wikipedia.org/wiki/Multiple_comparisons_problem) и/или посоветоваться со статистиком. Параллельно я написала комментарий эдитору журнала, что возможно авторы нуждаются в оценке их действий со стороны профессионального статистика, но с моей точки зрения такая статистика неприемлема и статья с ней не должна быть пропущена в печать. Отвечаю на недоумение тех, кто был удивлен что мол ревьювер с авторами напрямую общается, а эдитор (редактор) не в курсе. Это не так, конечно. Ревьюверы анонимны, их в данном журнале три. Авторам мы пишем комментарии в специальном окошке на вебсайте журнала. Там же есть второе окошко - для переписки с эдитором, которая не показывается авторам. Затем эдитор (редактор) собирает в одно большое письмо все, что написали ревьюверы авторам, читает что ревьюверы написали лично ему, принимает решение что делать со статьей и пересылает свое решение вместе с комментариями ревьюверов авторам статьи. И поскольку подобная проблема со статистикой была столь явной, я очень сильно удивилась что вторую версию статьи не завернули в тот же день на уровне прямо редактора, а вместо этого переслали нам, ревьюверам. Из этого я заключила что редактору под Новый Год и вокруг оного было очень уж лениво читать всю эту переписку, и он просто скопировал все это вместе да и отослал, а вторую версию статьи, не открывая даже, тоже переслал всем и ага. Я не знаю, чем кончится дело. Этот журнал не посылает итоговое решение ревьюверам.
По поводу вопросов "А что со статистикой там было не так, поясни мне пожалуйста, Collapse )